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O objetivo principal do setor de Toxicologia é identificar e quantificar através de técnicas avançadas, indicadores biológicos de exposições a agentes quÃmicos, como solventes (xileno, fenol, tolueno, anilina, nitrobenzeno, etilbenzeno, diclorometano e estireno) e metais (Cu, Cr, Al, Pb e Ni), além da quantificação de adenosina deaminase em fluÃdos biológicos.
O Balagué Center conta com equipamentos de última geração, adequados para execução das técnicas: Cromatografia LÃquida de Alta Performance (HPLC), Cromatografia Gasosa por Ionização de Chama (CG), Espectrofotometria por Absorção Atômica em Tubo de Grafite e Espectrofotometria por Absorção Molecular UV-VIS. A NR-7, norma regulamentadora no Brasil é utilizada como referência, contendo parâmetros para controle da exposição ocupacional a agentes quÃmicos, além da utilização de controles reconhecidos internacionalmente, como o BioRad e ControlLab.